为保证实验教学中心科学有效规范的运行，学校、学院、中心制定了一系列管理规章制度，包括：
1）实验室管理制度：《实验室设置与安全分类分级管理办法（试行）》、《实验室安全准入实施细则》、《实验室安全管理办法（试行）》、《南京航空航天大学实验室工作规程(试行)》、《实验室工作人员考核办法》、《本科教学实验室建设项目管理暂行办法》、《本科教学实验室建设专项经费管理暂行办法》、《开放性教学实验室建设标准》、《实验室开放管理办法》、《实验室低值耐用品、材料、易耗品管理规定》等。
2）仪器设备管理制度：《南京航空航天大学仪器设备验收管理办法》、《南京航空航天大学大型仪器设备共享管理办法（试行）》、《仪器设备采购招投标工作实施细则》、《贵重仪器设备共享使用管理暂行办法》、《仪器设备报废处理管理办法》、《仪器设备损坏、丢失赔偿管理规定》、《仪器设备档案管理办法》、《仪器设备的使用管理、维护、维修有关规定》、《仪器设备固定资产账务管理规定》、《仪器设备的调拨、借用管理规定》、《机械工程国家级实验教学示范中心自制仪器设备管理办法》。
3）实验教学管理制度：《本科实验（课）教学质量评估指标》、《实验教学管理办法》、《学生实验守则》、《实验教学管理制度》、《机械工程国家级实验教学示范中心计划外实验教学管理办法》、《实验教学考核与成绩评定的有关规定》、《机械工程国家级实验教学示范中心新实验开发管理实施办法》、《机械工程国家级实验教学示范中心教材编写管理与工作量核定办法》等。
4）大学生科技活动管理制度：《关于进一步加强大学生科技活动的意见》、《大学生科技创新基金管理细则》、《大学生科技创新活动与科技创新基金实施方案》。
5）消防和社会治安综合治理：《消防工作应知应会常识》、《社会治安综合治理应知应会常识》。
1.实验室管理制度 |  |
（2）实验室安全准入实施细则 | |
| 2.实验室人员管理制度 | |
（1）实验室人员岗位职责 （3）学生实验守则 | |
| 3.仪器设备管理制度 | |
（4）大型精密仪器设备管理方法 （5）仪器设备报废处理管理办法 |
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